Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
E2F1Q01094 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms