Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYBPC1Q00872 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYBPC1Q00872 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms