Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMF1P82094 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMF1P82094 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMF1P82094 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMF1P82094 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMF1P82094 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMF1P82094 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TMF1P82094 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
TMF1P82094 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMF1P82094 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMF1P82094 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMF1P82094 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TMF1P82094 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMF1P82094 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMF1P82094 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMF1P82094 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMF1P82094 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMF1P82094 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMF1P82094 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMF1P82094 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
TMF1P82094 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMF1P82094 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMF1P82094 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMF1P82094 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMF1P82094 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMF1P82094 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMF1P82094 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMF1P82094 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMF1P82094 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMF1P82094 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMF1P82094 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMF1P82094 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMF1P82094 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMF1P82094 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMF1P82094 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMF1P82094 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMF1P82094 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMF1P82094 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMF1P82094 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMF1P82094 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMF1P82094 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMF1P82094 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMF1P82094 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMF1P82094 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMF1P82094 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMF1P82094 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMF1P82094 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMF1P82094 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMF1P82094 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMF1P82094 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMF1P82094 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMF1P82094 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMF1P82094 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMF1P82094 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TMF1P82094 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TMF1P82094 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMF1P82094 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMF1P82094 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMF1P82094 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMF1P82094 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMF1P82094 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMF1P82094 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMF1P82094 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMF1P82094 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMF1P82094 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TMF1P82094 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms