Protein–RNA interactions for Protein: P78560

CRADD, Death domain-containing protein CRADD, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRADDP78560 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRADDP78560 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRADDP78560 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRADDP78560 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRADDP78560 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRADDP78560 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRADDP78560 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRADDP78560 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRADDP78560 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRADDP78560 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRADDP78560 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRADDP78560 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRADDP78560 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRADDP78560 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRADDP78560 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRADDP78560 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRADDP78560 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRADDP78560 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRADDP78560 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRADDP78560 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRADDP78560 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRADDP78560 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRADDP78560 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRADDP78560 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRADDP78560 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRADDP78560 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRADDP78560 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRADDP78560 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRADDP78560 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRADDP78560 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRADDP78560 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRADDP78560 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRADDP78560 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRADDP78560 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRADDP78560 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRADDP78560 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRADDP78560 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRADDP78560 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRADDP78560 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRADDP78560 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRADDP78560 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRADDP78560 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRADDP78560 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRADDP78560 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRADDP78560 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRADDP78560 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRADDP78560 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRADDP78560 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRADDP78560 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRADDP78560 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRADDP78560 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRADDP78560 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRADDP78560 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRADDP78560 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRADDP78560 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRADDP78560 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRADDP78560 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRADDP78560 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms