Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ELF3P78545 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELF3P78545 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELF3P78545 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELF3P78545 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELF3P78545 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELF3P78545 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELF3P78545 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ELF3P78545 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELF3P78545 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELF3P78545 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELF3P78545 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELF3P78545 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELF3P78545 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELF3P78545 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELF3P78545 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms