Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM193AP78312 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM193AP78312 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms