Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPFP62306 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SNRPFP62306 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms