Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP46P62068 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP46P62068 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP46P62068 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP46P62068 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP46P62068 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP46P62068 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP46P62068 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP46P62068 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP46P62068 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP46P62068 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP46P62068 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP46P62068 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP46P62068 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP46P62068 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP46P62068 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP46P62068 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP46P62068 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP46P62068 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP46P62068 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP46P62068 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP46P62068 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP46P62068 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP46P62068 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP46P62068 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP46P62068 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP46P62068 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP46P62068 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP46P62068 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP46P62068 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP46P62068 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP46P62068 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP46P62068 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP46P62068 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP46P62068 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP46P62068 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP46P62068 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP46P62068 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP46P62068 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP46P62068 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP46P62068 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP46P62068 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP46P62068 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP46P62068 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP46P62068 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP46P62068 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP46P62068 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP46P62068 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP46P62068 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP46P62068 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP46P62068 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP46P62068 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP46P62068 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP46P62068 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP46P62068 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP46P62068 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP46P62068 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP46P62068 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP46P62068 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP46P62068 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP46P62068 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP46P62068 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP46P62068 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP46P62068 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP46P62068 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP46P62068 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP46P62068 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms