Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVS71-1P61550 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms