Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTBP60709 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTBP60709 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTBP60709 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTBP60709 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTBP60709 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTBP60709 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTBP60709 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms