Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DCDC1P59894 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCDC1P59894 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms