Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIPK4P57078 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RIPK4P57078 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms