Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STX17P56962 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STX17P56962 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STX17P56962 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STX17P56962 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STX17P56962 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX17P56962 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX17P56962 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX17P56962 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX17P56962 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX17P56962 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX17P56962 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX17P56962 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX17P56962 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX17P56962 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX17P56962 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX17P56962 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX17P56962 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX17P56962 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms