Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms