Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms