Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OXCT1P55809 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OXCT1P55809 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms