Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP9P55211 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP9P55211 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP9P55211 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP9P55211 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP9P55211 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP9P55211 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP9P55211 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP9P55211 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP9P55211 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP9P55211 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP9P55211 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP9P55211 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP9P55211 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP9P55211 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP9P55211 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP9P55211 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP9P55211 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP9P55211 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP9P55211 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP9P55211 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP9P55211 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP9P55211 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP9P55211 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP9P55211 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP9P55211 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP9P55211 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP9P55211 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms