Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP7P55210 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP7P55210 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP7P55210 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP7P55210 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP7P55210 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP7P55210 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP7P55210 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP7P55210 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP7P55210 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP7P55210 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP7P55210 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP7P55210 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP7P55210 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP7P55210 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP7P55210 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP7P55210 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP7P55210 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP7P55210 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP7P55210 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP7P55210 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP7P55210 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP7P55210 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP7P55210 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP7P55210 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP7P55210 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP7P55210 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP7P55210 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP7P55210 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP7P55210 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP7P55210 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASP7P55210 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASP7P55210 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP7P55210 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP7P55210 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP7P55210 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP7P55210 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP7P55210 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP7P55210 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP7P55210 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP7P55210 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP7P55210 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP7P55210 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP7P55210 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP7P55210 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP7P55210 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP7P55210 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP7P55210 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP7P55210 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP7P55210 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP7P55210 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP7P55210 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP7P55210 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP7P55210 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP7P55210 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP7P55210 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP7P55210 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP7P55210 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms