Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MANFP55145 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MANFP55145 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MANFP55145 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MANFP55145 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MANFP55145 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MANFP55145 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MANFP55145 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MANFP55145 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MANFP55145 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MANFP55145 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MANFP55145 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MANFP55145 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MANFP55145 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MANFP55145 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MANFP55145 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MANFP55145 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MANFP55145 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MANFP55145 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MANFP55145 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MANFP55145 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MANFP55145 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MANFP55145 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MANFP55145 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MANFP55145 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MANFP55145 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MANFP55145 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MANFP55145 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MANFP55145 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MANFP55145 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MANFP55145 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MANFP55145 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MANFP55145 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MANFP55145 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MANFP55145 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MANFP55145 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MANFP55145 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MANFP55145 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MANFP55145 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MANFP55145 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MANFP55145 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MANFP55145 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MANFP55145 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MANFP55145 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MANFP55145 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MANFP55145 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MANFP55145 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MANFP55145 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MANFP55145 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms