Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA8P53708 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA8P53708 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA8P53708 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms