Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIMK2P53671 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIMK2P53671 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms