Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THOP1P52888 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THOP1P52888 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THOP1P52888 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THOP1P52888 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THOP1P52888 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THOP1P52888 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
THOP1P52888 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THOP1P52888 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
THOP1P52888 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THOP1P52888 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THOP1P52888 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THOP1P52888 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THOP1P52888 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THOP1P52888 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THOP1P52888 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THOP1P52888 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THOP1P52888 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THOP1P52888 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THOP1P52888 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THOP1P52888 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms