Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA3P52797 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms