Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR3P51677 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR3P51677 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR3P51677 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR3P51677 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR3P51677 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR3P51677 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR3P51677 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR3P51677 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR3P51677 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR3P51677 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR3P51677 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR3P51677 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR3P51677 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR3P51677 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR3P51677 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR3P51677 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR3P51677 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR3P51677 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR3P51677 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR3P51677 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR3P51677 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR3P51677 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR3P51677 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR3P51677 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR3P51677 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR3P51677 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR3P51677 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR3P51677 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR3P51677 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR3P51677 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR3P51677 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR3P51677 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR3P51677 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR3P51677 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR3P51677 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR3P51677 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR3P51677 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR3P51677 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR3P51677 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR3P51677 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR3P51677 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR3P51677 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR3P51677 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms