Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB28P51157 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB28P51157 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB28P51157 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB28P51157 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB28P51157 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB28P51157 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB28P51157 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB28P51157 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB28P51157 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB28P51157 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB28P51157 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB28P51157 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB28P51157 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB28P51157 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB28P51157 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB28P51157 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB28P51157 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB28P51157 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB28P51157 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB28P51157 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB28P51157 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB28P51157 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB28P51157 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB28P51157 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB28P51157 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB28P51157 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB28P51157 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB28P51157 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB28P51157 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB28P51157 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB28P51157 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB28P51157 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB28P51157 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB28P51157 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB28P51157 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB28P51157 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB28P51157 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms