Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HNMTP50135 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNMTP50135 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNMTP50135 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNMTP50135 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNMTP50135 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNMTP50135 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNMTP50135 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNMTP50135 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HNMTP50135 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNMTP50135 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HNMTP50135 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HNMTP50135 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HNMTP50135 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HNMTP50135 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HNMTP50135 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNMTP50135 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNMTP50135 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNMTP50135 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNMTP50135 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNMTP50135 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNMTP50135 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNMTP50135 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNMTP50135 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNMTP50135 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNMTP50135 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNMTP50135 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNMTP50135 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HNMTP50135 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNMTP50135 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNMTP50135 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNMTP50135 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms