Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC2P49815 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC2P49815 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC2P49815 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC2P49815 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC2P49815 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC2P49815 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC2P49815 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC2P49815 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC2P49815 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC2P49815 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC2P49815 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC2P49815 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC2P49815 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC2P49815 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC2P49815 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC2P49815 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC2P49815 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC2P49815 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC2P49815 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC2P49815 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC2P49815 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC2P49815 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC2P49815 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC2P49815 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC2P49815 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC2P49815 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC2P49815 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC2P49815 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC2P49815 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC2P49815 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC2P49815 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms