Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTPAP49638 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTPAP49638 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TTPAP49638 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTPAP49638 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTPAP49638 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTPAP49638 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTPAP49638 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTPAP49638 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTPAP49638 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TTPAP49638 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTPAP49638 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTPAP49638 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTPAP49638 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTPAP49638 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTPAP49638 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTPAP49638 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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