Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXNP49023 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXNP49023 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXNP49023 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXNP49023 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXNP49023 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXNP49023 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXNP49023 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PXNP49023 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PXNP49023 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PXNP49023 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PXNP49023 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PXNP49023 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PXNP49023 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PXNP49023 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PXNP49023 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PXNP49023 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PXNP49023 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PXNP49023 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXNP49023 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXNP49023 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PXNP49023 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PXNP49023 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PXNP49023 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PXNP49023 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PXNP49023 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PXNP49023 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PXNP49023 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PXNP49023 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PXNP49023 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PXNP49023 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PXNP49023 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PXNP49023 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PXNP49023 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PXNP49023 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PXNP49023 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PXNP49023 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PXNP49023 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PXNP49023 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PXNP49023 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PXNP49023 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PXNP49023 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXNP49023 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms