Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
NESP48681 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NESP48681 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NESP48681 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NESP48681 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NESP48681 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NESP48681 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
NESP48681 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NESP48681 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NESP48681 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NESP48681 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NESP48681 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NESP48681 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NESP48681 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NESP48681 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NESP48681 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NESP48681 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NESP48681 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NESP48681 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
NESP48681 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
NESP48681 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NESP48681 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
NESP48681 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NESP48681 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NESP48681 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
NESP48681 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NESP48681 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NESP48681 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
NESP48681 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
NESP48681 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NESP48681 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NESP48681 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NESP48681 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NESP48681 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NESP48681 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NESP48681 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NESP48681 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NESP48681 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NESP48681 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NESP48681 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NESP48681 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NESP48681 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NESP48681 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NESP48681 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NESP48681 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NESP48681 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NESP48681 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NESP48681 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NESP48681 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NESP48681 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NESP48681 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NESP48681 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NESP48681 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
NESP48681 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NESP48681 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NESP48681 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NESP48681 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NESP48681 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NESP48681 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
NESP48681 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
NESP48681 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
NESP48681 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
NESP48681 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
NESP48681 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
NESP48681 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
NESP48681 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
NESP48681 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
NESP48681 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
NESP48681 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
NESP48681 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
NESP48681 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NESP48681 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
NESP48681 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NESP48681 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
NESP48681 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
NESP48681 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NESP48681 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NESP48681 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NESP48681 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NESP48681 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NESP48681 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
NESP48681 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NESP48681 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NESP48681 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NESP48681 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NESP48681 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NESP48681 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NESP48681 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NESP48681 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NESP48681 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NESP48681 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NESP48681 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NESP48681 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NESP48681 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NESP48681 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
NESP48681 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
NESP48681 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NESP48681 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NESP48681 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
NESP48681 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms