Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCLMP48507 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCLMP48507 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCLMP48507 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCLMP48507 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GCLMP48507 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCLMP48507 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCLMP48507 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLMP48507 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLMP48507 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLMP48507 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLMP48507 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLMP48507 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLMP48507 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLMP48507 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLMP48507 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLMP48507 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLMP48507 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLMP48507 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLMP48507 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLMP48507 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLMP48507 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLMP48507 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLMP48507 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLMP48507 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLMP48507 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLMP48507 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLMP48507 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLMP48507 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLMP48507 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLMP48507 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLMP48507 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLMP48507 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLMP48507 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLMP48507 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLMP48507 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLMP48507 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms