Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX5P48382 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX5P48382 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX5P48382 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX5P48382 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX5P48382 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX5P48382 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX5P48382 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX5P48382 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX5P48382 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX5P48382 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX5P48382 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX5P48382 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX5P48382 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX5P48382 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX5P48382 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX5P48382 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RFX5P48382 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RFX5P48382 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RFX5P48382 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RFX5P48382 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX5P48382 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX5P48382 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX5P48382 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX5P48382 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX5P48382 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX5P48382 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX5P48382 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX5P48382 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX5P48382 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX5P48382 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX5P48382 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms