Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA4P48169 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA4P48169 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA4P48169 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA4P48169 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA4P48169 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA4P48169 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA4P48169 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA4P48169 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA4P48169 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA4P48169 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA4P48169 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA4P48169 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA4P48169 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA4P48169 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA4P48169 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA4P48169 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA4P48169 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA4P48169 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms