Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms