Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRXP46100 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRXP46100 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRXP46100 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRXP46100 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRXP46100 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRXP46100 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRXP46100 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRXP46100 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRXP46100 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRXP46100 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRXP46100 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRXP46100 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRXP46100 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRXP46100 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRXP46100 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRXP46100 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRXP46100 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRXP46100 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRXP46100 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRXP46100 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRXP46100 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRXP46100 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRXP46100 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRXP46100 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRXP46100 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRXP46100 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRXP46100 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRXP46100 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRXP46100 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRXP46100 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRXP46100 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATRXP46100 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRXP46100 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATRXP46100 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRXP46100 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms