Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC4P43686 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMC4P43686 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC4P43686 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms