Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRATP43155 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRATP43155 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRATP43155 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRATP43155 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRATP43155 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRATP43155 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRATP43155 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRATP43155 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRATP43155 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRATP43155 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRATP43155 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRATP43155 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRATP43155 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRATP43155 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRATP43155 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRATP43155 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRATP43155 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRATP43155 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRATP43155 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRATP43155 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRATP43155 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRATP43155 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRATP43155 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRATP43155 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRATP43155 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRATP43155 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRATP43155 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRATP43155 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRATP43155 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRATP43155 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms