Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA1P42261 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms