Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTR1BP42025 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.4 ms