Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDFT1P37268 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FDFT1P37268 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms