Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX11P35716 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX11P35716 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX11P35716 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX11P35716 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX11P35716 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX11P35716 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX11P35716 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX11P35716 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX11P35716 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX11P35716 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX11P35716 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX11P35716 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX11P35716 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX11P35716 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX11P35716 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX11P35716 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX11P35716 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX11P35716 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX11P35716 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX11P35716 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX11P35716 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX11P35716 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX11P35716 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX11P35716 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms