Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN2P35609 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN2P35609 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms