Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 OSBPL10-214ENST00000479173 554 ntTSL 45.27□□□□□ -1.574e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-216ENST00000584114 479 ntTSL 33.74□□□□□ -1.814e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 46.11□□□□□ -1.434e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 TNS3-211ENST00000474346 775 ntTSL 314.99□□□□□ -0.019e-11■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 ST6GAL1-214ENST00000455441 596 ntTSL 422.78■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 ST6GAL1-205ENST00000427315 544 ntTSL 422.54■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 ST6GAL1-216ENST00000458216 507 ntTSL 313.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 ST6GAL1-207ENST00000438590 608 ntTSL 312.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 ST6GAL1-206ENST00000430309 504 ntTSL 49.03□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 ST6GAL1-203ENST00000417392 707 ntTSL 28.79□□□□□ -12e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 11e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 318.44■□□□□ 0.549e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 314.63□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-221ENST00000567999 578 ntTSL 1 (best)23.93■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-224ENST00000569061 651 ntTSL 519.86■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-204ENST00000561784 612 ntTSL 419.34■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-203ENST00000561741 580 ntTSL 417.79■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-217ENST00000566820 549 ntTSL 417.69■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-216ENST00000566079 516 ntTSL 517.63■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-208ENST00000562578 573 ntTSL 417.63■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-209ENST00000562986 468 ntTSL 417.59■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-222ENST00000568096 543 ntTSL 517.53■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-220ENST00000567884 572 ntTSL 516.34■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-226ENST00000569803 539 ntTSL 515.87■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 DEF8-218ENST00000567243 550 ntTSL 514.77□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 LYPLA2-210ENST00000495365 842 ntTSL 217.97■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 LYPLA2-206ENST00000420982 614 ntTSL 315.63■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 TMEM129-205ENST00000480360 761 ntTSL 319.22■□□□□ 0.672e-11■■■■■ 36.1
GTF2F1P35269 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.754e-7■■■■■ 36.1
GTF2F1P35269 RHPN2-204ENST00000588388 2378 ntTSL 214.52□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 36.1
GTF2F1P35269 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 36.1
GTF2F1P35269 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.878e-8■■■■■ 36
GTF2F1P35269 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.218e-8■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-251ENST00000523797 405 ntTSL 325.48■■□□□ 1.673e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 423.02■■□□□ 1.283e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-254ENST00000524040 475 ntTSL 221.13■□□□□ 0.973e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-231ENST00000521332 630 ntTSL 421.13■□□□□ 0.973e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-219ENST00000520045 602 ntTSL 420.6■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-256ENST00000524257 430 ntTSL 411.77□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-214ENST00000519635 578 ntTSL 410.49□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-223ENST00000520828 574 ntTSL 49.46□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-205ENST00000517453 571 ntTSL 48.62□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 48.3□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PTK2-249ENST00000523679 504 ntTSL 37.95□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 36
GTF2F1P35269 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 03e-11■■■■■ 36
GTF2F1P35269 PIGG-222ENST00000513192 2241 ntTSL 1 (best)19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 PIGG-221ENST00000511666 658 ntTSL 318.23■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 PIGG-206ENST00000503261 626 ntTSL 517.24■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 PIGG-209ENST00000504879 445 ntTSL 314.46□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 PIGG-223ENST00000513239 3519 ntTSL 1 (best)12.62□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 PFKFB4-211ENST00000471890 553 ntTSL 415.4■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 57.68□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.34e-9■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 STAG3L3-202ENST00000428423 2137 ntTSL 315.3■□□□□ 0.045e-17■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-17■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 35.9
GTF2F1P35269 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.945e-7■■■■■ 35.8
GTF2F1P35269 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 35.8
GTF2F1P35269 TRPM4-214ENST00000601347 642 ntTSL 416.34■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-10■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.139e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.19e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.039e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.039e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.029e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 KCNN1-203ENST00000609922 499 ntTSL 327.07■■□□□ 1.929e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.899e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 EGLN2-208ENST00000593972 935 ntTSL 226.6■■□□□ 1.859e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-211ENST00000567444 635 ntTSL 225.95■■□□□ 1.749e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 EGLN2-215ENST00000598654 590 ntTSL 325.2■■□□□ 1.629e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.559e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.369e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.319e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 SCARF1-206ENST00000573852 2698 ntTSL 1 (best)22.65■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.213e-7■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-207ENST00000563012 646 ntTSL 322.23■■□□□ 1.159e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 SCARF1-208ENST00000574545 894 ntTSL 1 (best)21.91■■□□□ 1.13e-7■■■■■ 35.7
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 74.5 ms