Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP2P32456 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP2P32456 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP2P32456 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP2P32456 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP2P32456 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP2P32456 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP2P32456 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP2P32456 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP2P32456 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP2P32456 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP2P32456 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP2P32456 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP2P32456 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP2P32456 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP2P32456 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP2P32456 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP2P32456 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP2P32456 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP2P32456 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP2P32456 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP2P32456 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP2P32456 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP2P32456 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP2P32456 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP2P32456 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP2P32456 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP2P32456 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP2P32456 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP2P32456 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms