Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA13P31271 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA13P31271 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms