Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms