Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFS1P28331 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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