Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR2F2P24468 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms