Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCND1P24385 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND1P24385 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND1P24385 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND1P24385 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND1P24385 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND1P24385 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND1P24385 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND1P24385 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND1P24385 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCND1P24385 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCND1P24385 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCND1P24385 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND1P24385 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND1P24385 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND1P24385 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND1P24385 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND1P24385 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND1P24385 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND1P24385 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND1P24385 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND1P24385 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCND1P24385 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCND1P24385 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCND1P24385 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCND1P24385 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCND1P24385 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCND1P24385 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCND1P24385 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms