Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCSHP23434 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCSHP23434 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCSHP23434 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCSHP23434 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCSHP23434 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCSHP23434 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCSHP23434 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCSHP23434 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCSHP23434 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCSHP23434 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCSHP23434 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCSHP23434 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCSHP23434 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCSHP23434 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCSHP23434 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCSHP23434 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCSHP23434 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms